La vie de Megaman et Lan n'est pas simple. Voilà encore un nouvel ennemi, Bass, qui semble invulnérable. Il s'agit en réalité du plus ancien Navi, le gardien du réseau, et une grande instabilité règne sur la toile car il semble avoir perdu la raison. Heureusement Megaman accueillera de nouvelles compétences dans ce volet, avant le retour des quatre gardiens du monde trois (aussi collant que la Team Rocket ...)

A leur tête, le vilain Dr Willy qui désire plus que jamais la destruction des terminaux personnels. En effet sans ce précieux sésame, les Navi ne peuvent être contrôlés. Pourtant la menace ne sera pas très concluante comparé à Proto, une chose obscure crée par la société des réseaux informatiques. Parallèlement il est proposé à Lan de devenir citoyen du Net et de passer l'examen. Après avoir réussi les tests, voici que Bass revient faire des siennes. Comment notre duo va t-il s'en sortir ? Réponse dans le dernier tome en Mars prochain.