Le studio Shin'en a déclaré que le jeu Nano Assault EX (3DS) , à paraître cet automne sur eShop, comportera quelques améliorations par rapport à la version cartouche (jamais commercialisée en Europe). Outre des graphismes affinés, on comptera un mode Survivor, la présence de tableaux de classements en ligne, et le support du Pad Circulaire Pro.