La Team Ninja a déclaré vouloir faire de Ninja Gaiden Sigma 2  un jeu élégant et sexy, et pas aussi violent que les autres volets de la série. Selon le producteur et réalisateur du jeu, Yosuke Hayashi, l'équipe travaillant dessus est de "nature égoïste" et s'ennuie à développer  "le même concept encore et encore". C'est pourquoi Tecmo veut éviter une conversion directe du jeu Xbox 360.

Hayashi san ne veut pas partir dans les excès, mais ajoute qu'il est "temps de commencer l'évolution de ce jeu".