Des sites miniers sont menacés par des vagues de robots envahisseurs. L’écran de la TV affiche les 12 caméras de surveillance que vous avez placées afin de repérer les ennemis pour les détruire avant qu’ils n’atteignent le générateur.
A plusieurs, l’aventure s’annonce plus fun puisque les amis peuvent participer et voir de quels côtés arrivent les envahisseurs et annoncer le numéro de caméra correspondant.
Les amiibo Fox et Falco sont également de la partie, et permettent d’effectuer une fois par jour une puissante frappe aérienne destructrice.
Accomplir des missions rapporte des métaux rares qui débloquent de nouvelles missions ainsi que des caméras spéciales pouvant ralentir ou figer les ennemis par exemple.
Le mode « Votre troupe » est destiné aux plus grands tacticiens qui peuvent poster leurs propres schémas d’attaques ennemies, pour défier les joueurs du monde entier.
Le mode Super stratège, quand à lui, sera constamment mis à jour pour proposer quotidiennement un nouveau défi.
Les joueurs qui achètent Star Fox Zero pourront essayer la démo téléchargeable exclusive de Star Fox Guard. Les données sauvegardées seront transférées de la démo à la version complète pour que les joueurs puissent reprendre leur partie là où elle s'est arrêtée.