Ben Gannon (Josh Lucas), Kara Wade (Jessica Biel) et Henry Purcell (Jamie Foxx) sont les pilotes d'essai d’avions de combats furtifs. Ils sont les meilleurs, et le savent.

Le commandant Cummings leur présente un nouveau venu au sein de leur équipe : E.D.I., un avion de combat pourvu d’une intelligence artificielle et n’ayant donc pas besoin d’être piloté par un humain. L'équipe est assez sceptique, surtout Ben, mais lors de leur première mission, EDI se révèle un « pilote » hors pair et élimine leur cible avec succès. Cependant, sur le vol de retour, EDI est violemment frappé par la foudre, et ses réactions deviennent étranges. Cummings le déclare toujours bon pour le service mais bien vite la situation semble s'échapper : En effet, EDI va connaître de nouvelles défaillances lors d'une seconde mission, contre un baron du crime disposant d'armes nucléaires en Chine cette fois. EDI ne répond plus aux ordres
et il va falloir l'arrêter avant qu’une guerre nucléaire ne soit déclenchée. Ben est le seul à pouvoir le faire ...