Casey est le seul combattant américain ayant eu l'honneur d'intégrer la plus prestigieuse école d'arts martiaux japonaise, Lorsqu'un ancien disciple, Masayuki, qui est passé aux ordres de la terrible et mystérieuse organisation du TEMPLE attaque l'établissement et massacre la plupart des étudiants, le Maître est contraint de demander à Casey d'accompagner sa fille Namiko à New York, C'est là qu'ils pourront mettre en sécurité l'armure sacrée de YOROI BITSU, une arme ancestrale aux pouvoirs illimités. Casey et Namiko vont devoir défendre l'artefact face à une armée d'assassins et de gangs sanguinaires tous aux ordres de Masayuki.

Le début du film Ninja est plutôt convaincant. Il nous amène au Japon, dans une école de formation de shinobi. Rapidement, des tensions se créent entre les deux élèves les plus doués, l'un est américain (le héros du film), l'autre est japonais (Masayuki). Le fait que la fille du maître, Namiko, ne soit pas insensible aux charmes de Casey, jouera également en sa défaveur. Bref, le disciple va passer du côté obscur, et n'aura de cesse que de préparer sa vengeance.  Mais si l'action ne manque pas de rythme, le scénario est quasi inexistant, les personnages sont assez caricaturaux et nous plongent parfois en pleine série Z.