Les survivants des colonies de Kobol partent à la recherche de la mythique 13eme colonie, la Terre, avec à leurs trousses leurs ennemis jurés, les Cyclons. Battlestar Galactica fait suite à la célèbre saga de science-fiction de la fin des années 70. Cette première saison fut tournée en 2004 et comprend 13 épisodes réunis sur 4 DVD.

1 - 33 minutes (33)
Le Galactica et toute la flotte sont contraints d'effectuer des sauts intergalactiques afin d'échapper aux vaisseaux Cylons qui apparaissent toutes les 33 minutes. Il en sont au 237ème saut... quand un vaisseau de transport de civil, le "Olympic Carrier", manque à l'appel après un saut puis réapparaît mystérieusement un peu plus tard, le commandant Adama craint que ce vaisseau n'ait été infiltré par les Cylons
2 - L'eau (Water)
Le lieutenant Sharon Valerii reprend conscience, trempée avec des explosifs dans son sac mais n'ayant aucun souvenir de ses actes. Elle demande de l'aide au chef Tyrol. Peu de temps après, une explosion se produit, vidant les réservoirs d'eau du Galactica. Le commandant Adama et la présidente Roslin doivent faire face au manque d'eau mais également au possible sabotage d'un Cylon.
3 - Révolution (Bastille Day)
De l'eau a finalement été trouvé mais une planète pleine de glace. L'extraction reste difficile et 1000 hommes sont nécessaires. Le commandant et la présidente décident donc d'envoyer le capitaine Apollo sur l'Astral Queen. Adama recrute des volontaires parmi les détenus en échange de points pour leur liberté.
4 - Confession (Act of Contrition)
13 pilotes trouvent la mort lors d'un accident dans le Galactica. Le commandant Adama charge alors le lieutenant Thrace de former des nouvelles recrues. Mais la jeune femme, qui culpabilise depuis la mort de son fiancé Zak, craint de ne pas être à la hauteur.
5 - Crash sur la lune (You Can't Go Home Again)
Le lieutenant Starbuck est portée disparu à la suite d'un affrontement avec les Cylons lors d'une séance d'entraînement. Lee et le commandant Adama mettent tout en oeuvre pour la retrouver. Les chances de la retrouver sont très minces, d'autant plus que Starbuck n'a que peu d'oxygène.
6 - L'attentat (Litmus)
Adama reconnaît un Cylon d'apparence humaine, qui a provoqué une explosion faisant plusieurs morts. Cet incident oblige le commandant et le Président à révéler aux civils que certains Cylons peuvent avoir une apparence humaine.
7 - Les Croyances de Baltar (Six Degress of Separation)
Quand le docteur Baltar et Numéro 6 ont une dispute, elle disparaît de sa tête. Peu de temps après, une femme du nom de Shelley Godfrey, analyste des systèmes au ministère de la Défense et ressemblant trait pour trait à Numero 6 monte à bord du Galactica, avec des preuves de la trahisons de Baltar. Il aurait remis des plans importants aux Cylons.
8 - De chair et de sang (Flesh and Bone)
La Présidente est prévenue qu'un Cylon du nom de Leobon Conroy (ou plutôt sa copie), a été trouvé à bord de la flotte. Kara est chargé de l'interroger et apprend qu'une bombe nucléaire se cacherait sur un des vaisseaux.
9 - Le retour d'Hélène (Tigh Me Up, Tight Me Down)
Le Dr Baltar a enfin mis au point le détecteur de Cylons mais la procédure pour le mettre en place semble bien longue. Pendant ce temps la Présidente soupçonne Adama d'être un Cylon justement et désire qu'il teste la machine. Mais ce dernier a disparu.
10 - Le minéral de Tylium (Hand of God)
Le carburant commence à manquer et il faut rapidement trouver du tylium, ce qui ne tarde pas à être fait. Un astéroïde a en effet été reperé mais malheureusement il s'agit d'une base ennemi, compliquant les affaires de la flotte. La président Roslin est victime d'hallucinations à cause de son médicament. Elle consulte la prêtresse Elosha dans le but d'interpréter ses visions en rapport avec une vieille prophétie...
11 - La fête coloniale (Colonial Day)
La présidente Roslin organise une réunion des représentants des 12 colonies à bord du Cloud Nine, le vaisseau le plus impressionnant de la flotte. Il s'agit en effet du 52ème anniversaire de la signature de la Colonisation. Mais Tom Zarek, le terroriste charismatique et élu représentant de la colonie du Sagittaire, propose l'élection d'un vice président, ce qui pourrait être une menace.
12 - A la recherche de la Terre - 1ère Partie (Kobol's Last Gleaming - Part 1)
Sharon a découvert une planète qui pourrait être Kobol, la légendaire planète des Dieux. Cependant sur le Galactica se passent des évènements troubles. On a découvert que Sharon est en effet une Cylon, et Le Vice Président Baltar qui a passé une nuit avec Kara, ne supporte pas de la voir dans les bras du lieutenant Thrace. La situation apparaît donc confuse mais la Présidente tente de convaincre le commandant Adama que la Terre, 13ème colonie tant recherchée, n'est plus très loin.
13 - A la recherche de la Terre - 2ème Partie (Kobol's Last Gleaming - Part 2)
Roslon convaint Starbuck de se rendre sur Kobol afin de ramener la flèche d'Appolon, censée d'après la prophétie les mener sur Terre. Sur Caprica, Kara la trouve bientôt mais Numéro Six surgit bientôt. Le commandant Adama envoie pendant ce temps Sharon en mission sur la base des Dylons, pour la détruire afin de récupérer l'équipe de reconnaissance qui s'est écrasé sur la planète. Furieux de l'intrusion de la Présidente dans les décisions militaires, Adama ordonne son arrestation. Mais personne ne cède et tout pourrait bien vite dégénérer.