Konami a confirmé que « Metal Gear Solid : Master Collection Vol. 2 » inclura de nouvelles fonctionnalités liées à « Metal Gear Solid 4 : Guns of the Patriots ». L'élément central est un « anneau de menace » qui apparaît autour de Solid Snake dans « Metal Gear Solid 4 : Guns of the Patriots » et signale visuellement les ennemis à proximité. Selon sa couleur et sa forme, l'anneau indique la distance et le niveau de danger des menaces.

Cela permet de s'orienter plus facilement en mode infiltration sans avoir constamment recours aux affichages traditionnels. Cette fonction ne peut être activée qu'en position accroupie ou allongée, ce qui la rend particulièrement utile dans le silence.

De plus, Konami introduit un autre système appelé « Flashback », qui permet de revisiter des scènes familières des précédents opus de la série. À certains moments, les personnages se remémorent des événements passés, ce qui clarifie les liens narratifs.